Todo mundo que usa linux fica pagando de cabuloso, q preguiça
Cara, se vc quiser um server pra zuar e talz pegue o Windows, o Linux por si só não vai te proteger de DDoS etc.. Se quiser proteção precisa de uma máquina boa (quad core 4gb+) dedicada e uma proteção DDoS à parte (6gb/segundo pra cima), dai c não deve ter tanta dor de cabeça, pelo menos não com lammer...
Agora, se vc não tem intenção de fazer um grande servidor, pode usar windows sem problemas...